O Reiki foi descoberto por Mikao Usui, numa aldeia chamada Yago na região de Yamagata no Japão. Como e dito por Frank Arjava em seu livro "Reiki Fare", sensei Usui nasceu no vilarejo de Yago, em Yamagata, distrito de Gifu, no primeiro ano do período meio guinem. Mais precisamente em 15 de gosto de 1865. Seu premiro nome era Gyoho, o sobrenome de Pai era Uzaemon e de sua Mãe Kaweai. O que se saberá respeito de Dr.Usui e que era muito estudioso, e que na idade adulta viajou por vários países do Oriente,inclusive a China. Um dia subiu ao monte Kurama onde existem vários templos da doutrina Budista Kurama - Kokyo, e permaneceu jejuando e meditando por 21dias. No final deste período sentiu a grandiosa energia do Reiki entrando pelo topo de sua cabeça, experiência que o levou a criar o sistema de Reiki de Cura Natural. Sua fama se espalhou rapidamente e ele começou a viajar por todo o Japão. FOi em uma destas viagens, em 9 de marco de 1926, na cidade de Fuukuyana, que faleceu aos 62 anos. Dr. Usui teve má esposa que se chamava Sadako e com ela teve 2 filhos, ,um homem e uma mulher. Seu filho, Fuji Usui ficou responsável pelos negócios da família após a morte de seu pai.